生物肥料的种类很多，按生物有机肥厂家制品中特定的微生物种类分为细菌肥料、放线菌肥料、真菌类肥料、固氮蓝藻肥料等。根据生物肥厂家生产的生物肥作用不同可分为以下四大类：
1、有固氮作用的生物肥如根瘤菌肥料、固氮菌肥料以及固氮蓝藻等；
2、分解土壤有机物的生物肥如有机磷细菌肥料和复合细菌肥料；成都微生物菌剂
3、分解土壤中难溶性矿物的生物肥如硅酸盐细菌肥料、无机磷细菌肥料等；
4、促进作物对土壤养分利用的生物肥如菌根菌肥料等。成都有机肥发酵菌种